Составные части мужской мочеполовой системы размещены в задней части живота, в тазовой полости и снаружи тела между бедрами, и рассматриваются на следующих двух иллюстрациях
(рис. 49 и 50) с правой стороны. Правая почка на этих рисунках не видна, но показан правый мочеточник, тянущийся назад к тазу и вступающий в мочевой пузырь под прямой кишкой. Суженная шейка мочевого пузыря дает начало уретре, но, в отличие от кобылы, уретра жеребца не является коротким образованием, а продолжается через всю длину его полового члена. Внутри собственно таза тазовая часть уретры достаточно широкая (до 6 см).
Два семенника жеребца - важнейшие репродуктивные железы, в которых вырабатываются спермин, каждый имеет длину до 12 см и яйцевидную форму, весом около 300 г; левый обычно крупнее правого. Поскольку выход спермиев связан с размером семенника, для племенного жеребца, вероятно, важны крупные семенники. Семенники лежат не в собственно брюшной полости (хотя у эмбриона они развиваются там), а в предлонной области под пенисом между бедрами, заключенные в выпячивание брюшной полости, окруженное кожей, - мошонку. Опущение семенников обычно происходит в течение последнего месяца развития плода. Кожа мошонки имеет относительно мало волос, но хорошо снабжена потовыми и сальными железами. В околородовой период (возможно несколько дней до или после рождения) семенники мигрируют (опускаются) из эволюционного положения развития в своде брюшной полости через паховые каналы (постоянные каналы через слои брюшной стенки) в мошонку. В ходе этого опущения трубка (семявыносящий проток), которая проводит спермин от семенника, выталкивается вместе с ним, наряду с его кровеносными сосудами и нервами (совокупная структура образует семенной канатик). Этот канатик можно увидеть идущим от семенника внутри влагалищного мешка мошонки через паховый канал (показан в схематичной форме) в брюшную полость. Оказавшись в брюшной полости, семявыносящий проток изгибается каудально к тазу, пересекается с мочеточником и идет рядом с мочевым пузырем, открываясь вместе со своей парой с противоположной стороны в уретру на некотором расстоянии от шейки мочевого пузыря. Впадение несколько более сложное, чем предполагает это описание, поскольку стенка семявыносящего протока на протяжении последних 20 см (или около) утолщена вокруг просвета, образуя секреторную ампулу, которая соединяется с протоком близлежащей пузырьковидной железы, образуя общий семявыбрасывающий проток. Этот проток затем открывается в свод уретры вместе со своим аналогом с противоположной стороны.